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Distribution des génovars des souches urogénitales de Chlamydia trachomatis en France métropolitaine et outre-mer en 2017-2018.


Auteurs physiques : DE BARBEYRAC (B.), LAURIER-NADALIE (C.), TOUATI (A.), TROMBERT-PAOLANTONI (S.), PEUCHANT (O.), NDEIKOUNDAM NGANGRO (N.), BEBEAR (C.)
Titre du périodique : BULLETIN EPIDEMIOLOGIQUE HEBDOMADAIRE
Numéro du fascicule : 4
Année d'édition : 2021/03/16
Pagination : 58-64
ISSN : 0245-7466
Résumé : Introduction - Le Centre national de référence des infections sexuellement transmissibles (IST) bactériennes a entrepris une étude comparative des génovars circulant dans l'infection urogénitale à Chlamydia trachomatis en France métropolitaine et dans les territoires et régions d'outre-mer (DROM). Méthodes - Deux collectes prospectives d'échantillons urogénitaux positifs à C. trachomatis ont été organisées, l'une en 2017 (semaine 46) en France métropolitaine et l'autre en 2018 (semaines 38 à 42) dans les DROM, accompagnées du recueil de données démographiques, cliniques et comportementales. Les échantillons ont été typés par séquençage du gène omp1, déterminant les génovars. Résultats - Sur les 1 861 échantillons collectés, 1 353 (72,7%) ont pu être typés, 772 de France métropolitaine et 581 des DROM. L'ensemble des génovars D à K sont présents en métropole et dans les DROM, avec une prédominance du génovar E (n=591, soit 43,7%). La distribution des génovars est sensiblement la même dans toutes les zones géographiques étudiées, avec cependant une présence des souches de génovar G (n=15 ; 29,4% ; p<0,05) en Polynésie et de génovar J/Ja (n=21 ; 27,3% ; p<0,05) en Nouvelle-Calédonie, statistiquement plus élevée que dans les autres zones. Un fait notable est la présence de souches de génovar A (n=21 ; 5,8%), spécifique du trachome, dans l'océan Indien. Conclusions - La distribution des génovars en France métropolitaine et ses DROM est similaire à celle décrite dans les autres pays du monde avec une grande prédominance des génovars E, F, G et D. La présence du génovar A dans l'infection urogénitale dans l'océan Indien est le fait le plus marquant de cette étude.
Mots-clés : Appareil urogénital [pathologie], Chlamydia, Chlamydiose, France, Réseau surveillance, 2017-2018
Mots-clés libres : IST, GENOVAR
Localisation : ORSRA : 17870

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